肉牛遺傳育種技術(shù)
相傳我國(guó)古代齊國(guó)大夫?qū)幤?，撰?xiě)了《齊侯大夫?qū)幤菹嗯＝?jīng)》，后成為相牛圣典，人們僅憑牛只的體型外貌、牙齒等，便會(huì)推斷牛只生育情況、是否耐勞肯干等信息，并會(huì)有選擇性的繁育發(fā)展。這便是早期的“遺傳育種”，隨著經(jīng)驗(yàn)及技術(shù)的長(zhǎng)期積累發(fā)展，遺傳育種技術(shù)早已今非昔比，已經(jīng)從生產(chǎn)性能測(cè)定、遺傳評(píng)估、選種選配的常規(guī)育種時(shí)代進(jìn)入基因組選擇育種時(shí)代。
基因組選擇育種技術(shù)可利用覆蓋全基因組的高密度遺傳標(biāo)記計(jì)算個(gè)體的基因組估計(jì)育種值。相較基于系譜信息的估計(jì)育種值，該技術(shù)通常能獲得更高的估計(jì)準(zhǔn)確性，可大幅縮短世代間隔，提高遺傳進(jìn)展，提高經(jīng)濟(jì)效益。
基因組選擇育種涉及到多環(huán)節(jié)，其中最重要的3個(gè)環(huán)節(jié)分別是性能測(cè)定，基因測(cè)序，統(tǒng)計(jì)模型構(gòu)建。
性能測(cè)定依托于智能化表型設(shè)備，準(zhǔn)確、高效、智能的表型搜集技術(shù)是育種的前提和關(guān)鍵工作?；蚍中蛿?shù)據(jù)主要通過(guò)芯片測(cè)序或二代測(cè)序獲得，這兩種方法都有各自的應(yīng)用場(chǎng)景。在遺傳育種領(lǐng)域，由于芯片測(cè)序成本低，準(zhǔn)確性高，是目前主流的育種測(cè)序技術(shù)。隨著測(cè)序成本的下降，二代測(cè)序會(huì)越來(lái)越多的應(yīng)用在育種領(lǐng)域。
Illumina BeadArray芯片結(jié)構(gòu)
按模型方法不同，基因組選擇統(tǒng)計(jì)模型主要分為BLUP系列，貝葉斯系列，機(jī)器學(xué)習(xí)系列。
歐洲和美洲的肉牛遺傳評(píng)估平臺(tái)主要采用BLUP系列，國(guó)內(nèi)的華西牛遺傳評(píng)估平臺(tái)主要采用貝葉斯系列。隨著大數(shù)據(jù)的發(fā)展，機(jī)器學(xué)習(xí)的算法越來(lái)越多的應(yīng)用在基因組選擇中。機(jī)器學(xué)習(xí)的優(yōu)勢(shì)在于通過(guò)學(xué)習(xí)多個(gè)體互作或特征間的相關(guān)性，提高計(jì)算的準(zhǔn)確性，而且允許重定義訓(xùn)練和驗(yàn)證集以及交叉驗(yàn)證。
最近幾年來(lái)，遺傳育種技術(shù)的研究熱點(diǎn)集中于依托低深度重測(cè)序技術(shù)和機(jī)器學(xué)習(xí)模型提高基因組選擇的準(zhǔn)確性，提高計(jì)算效率，節(jié)省運(yùn)算時(shí)間。
另一方面，基因組選擇和胚胎移植，胚胎干細(xì)胞，基因編輯技術(shù)相結(jié)合，可大幅提高遺傳進(jìn)展。
作為一家以生物育種為核心的國(guó)家級(jí)高新技術(shù)企業(yè)，力牧生物以“繁”和“育”為主線(xiàn)業(yè)務(wù)，已經(jīng)建立分子育種、全基因組選擇、胚胎工程技術(shù)平臺(tái)，旨在建立以數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的育種新模式，推動(dòng)遺傳技術(shù)發(fā)展，以向畜牧業(yè)提供良種繁育整體解決方案。
胚胎干細(xì)胞育種體系
作者：會(huì)萍
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